Projekt eKasa rozšíril aj proklientske opatrenia finančnej správy. Finančná správa priebežne vyhodnocuje informácie zo systému eKasa. V prípade, že identifikuje v systéme eKasa neobvyklú transakciu, upozorní na to podnikateľa. Príkladom je ostatný prípad používateľa virtuálnej registračnej pokladnice, ktorý omylom zaevidoval v systéme eKasa miliardovú transakciu. Finančná správa vie v takýchto situáciách okamžite zasiahnuť a na prípadné nezrovnalosti upozorniť.